日本植物形態学会は、植物の形態・構造、そしてその機能に関連した分野の研究者が、新しい技術や理論、そして研究の発展方向などを積極的に議論し、実質的な相互の交流の場を持とうという趣旨のもと1988年１月に設立された学術研究団体です。
総会・大会を年１回開催しているほか、学会誌Plant Morphologyを年１回、刊行しています。また、植物形態学分野で優れた業績を挙げた研究者／研究の顕彰も行っています。