日本進化学会は、進化に関する広範な研究および教育を推進し、我が国におけるこの分野の発展に寄与することを目的に設立されました。年１回の学術集会では、研究発表、優秀発表の表彰、初心者向け教育プログラム、高校生発表会、市民向け講演会を行っています。日本進化学会賞、研究奨励賞、教育啓発賞により研究の奨励と一般への研究成果の発信を行っています。日本進化学会ニュースを年３回発行し、会員間での情報の共有を行っています。国内外の関係団体と国際学会などとの共催を通して進化学の国際化に寄与しています。