毎年、大会（９月）、分科会（３月＠遺伝研）、市民公開講座、談話会を開催。DOAJに登録されたオープンアクセス国際誌「Genes & Genetic Systems（年６回）」発行。学会賞（木原賞）、奨励賞、GGS prize、ベストペーパー賞、学生発表賞（修士学生対象）を設け、優れた研究を表彰。退職した研究者の活躍の場「シニア科学アカデミー」設立。分子から集団遺伝学、進化、エピジェネティクス、バイオインフォマティクスまで幅広い研究分野をカバー。